داستان فیلم «فیل در تاریکی» درباره یک جوان دانشجو است که در سالهای قبل از انقلاب اتومبیلی را وارد ایران میکند، بی خبر از آن که داخل اتومبیل مواد مخدر جاسازی شده است. قاچاقچیها، جوان را گروگان میگیرند و برادر جوان وی تلاش برای آزاد شدن این دانشجو را آغاز میکند و….